Laboratorio di ecosistemi microbici in medicina umana

Ambiti di ricerca:

1. Studio di ecosistemi microbici umani in condizioni fisiologiche e patologiche, con particolare focus su microbioma vaginale, faringeo, intestinale e oculare;
2. Studio del metaboloma microbico in differenti condizioni;
3. Interazione tra batteri health-promoting e patogeni del tratto urogenitale;
4. Valutazione in vitro dei meccanismi fisio-patogenetici nelle infezioni da Chlamydia trachomatis e Neisseria gonorrhoeae;
5. Epidemiologia molecolare delle infezioni da Chlamydia trachomatis e Neisseria gonorrhoeae;

Progetti di ricerca:

1. Ruolo del microbioma e metaboloma vaginale in gravidanza e suo impatto sull'outcome del parto.
2. Studio del microbioma oculare in pazienti con Graft vs Host Disease.
3. Studio del microbioma e metaboloma vaginale in donne con sindrome genito-urinaria della menopausa.
4. Studio dell’urobioma in donne con uretrite da Chlamydia trachomatis.
5. Studio del microbioma in donatori di microbiota fecale.
6. Studio del microbioma vaginale e rettale in donne con infezione da Chlamydia trachomatis e distribuzione dei geni di resistenza a tetracicline e macrolidi.
7. Valutazione del metaboloma di Candida In condizione di stress indotto da farmaci antifungini.
8. Valutazione di attività prebiotica e antimicrobica di lattobacilli di origine vaginale nei confronti di patogeni del tratto urogenitale.
9. Meccanismi patogenetici di Chlamydia trachomatis in modelli cellulari in vitro, con particolare focus su metabolismo e interazioni di membrana.
10. Effetti antimicrobici di sostanze naturali nei confronti di patogeni del tratto urogenitale.
11. Colonizzazione e tipizzazione molecolare di Neisseria meningitidis in pazienti MSM con infezione faringea da gonococco.
12. Distribuzione dei genotipi di gonococco in sede genitale in soggetti al alto rischio.
    
    

Strumentazione:

• PROMEGA MAXWELL MDx estrattore
• Termociclatore Applied Biosystems QUANTSTUDIO 1 
• 2 termociclatori per PCR end-point
• Bagnetto termostatato
• Congelatore -80°C
• Incubatori a CO₂
• Frigoriferi 4° C e Congelatori -20°C
• Centrifuga da banco
• Centrifuga Allegra X-12R
• Ultracentrifuga L-70 (Beckman)
• Agitatore
• Cappa Biohazard Jupiter
• Cappa a flusso laminare
• Microscopio ottico e a fluorescenza (Nikon)
• Microscopio invertito per colture cellulari (Nikon)
• Omogeneizzatore da laboratorio Stomacher
• Sistema acquisizioni immagini collegato a transilluminatore UV/luce bianca (Biorad).

Collaborazioni

Prof. Luca Laghi (DISTAL);

Prof. Vittorio Sambri (DIMES);

Dott.ssa Sara Zagonari (AUSL Romagna)

Prof.ssa Piera Versura (DIMES);

Prof.ssa Maria Cristina Meriggiola (DIMEC);

Dott. Marco Severgnini e Dott.ssa Clarissa Consolandi (CNR, Milano);

Prof. Vincenzo Stanghellini, Prof. Giovanni Barbara, Prof.ssa Patrizia Brigidi e Prof. Andrea Pession (DIMEC);

Prof.ssa Maddalena Rossi (UNIMORE);

Dott.ssa Monica Cricca (DIMES);

Prof.ssa Beatrice Vitali (FaBiT);

Prof.ssa Natalia Calonghi (FaBiT);

Prof. Gianandrea Pasquinelli (DIMES);

Dott.ssa Valeria Gaspari (U.O. Dermatologia, Sant’Orsola);